AutorgKek

Submodules

• AutorgKek.AppVersion
  • autoguinier_version_for_publication()
  • get_com_version_string()
• AutorgKek.AtsasTools
  • autorg()
• AutorgKek.BiComponentSolver
  • BiComponentSolver
    • BiComponentSolver.compute_G2()
    • BiComponentSolver.equations()
    • BiComponentSolver.evaluate()
    • BiComponentSolver.evaluate_gp()
    • BiComponentSolver.lmfit_model()
    • BiComponentSolver.prepare_equation_data()
    • BiComponentSolver.solve()
• AutorgKek.ClientServer
• AutorgKek.CommandLineOptions
• AutorgKek.CommandMain
  • CommandMain
    • CommandMain.execute()
    • CommandMain.run()
    • CommandMain.run_as_a_server()
  • autorg_func()
• AutorgKek.CommandMainUtils
  • do_CommandMain()
• AutorgKek.DataModels
  • GuinierPorod
  • GuinierPorodGeneral
  • GuinierPorodGeneralLmfit
  • GuinierPorodLmfit
• AutorgKek.DataModelsAgg
  • GuinierPorodAgg
• AutorgKek.DataModelsTripple
  • GuinierPorodTripple
• AutorgKek.ErrorResult
  • ErrorFit
  • ErrorFitResult
  • ErrorResult
• AutorgKek.Guinier
  • Guinier
    • Guinier.compute_anomaly_indeces()
    • Guinier.compute_bicomponent_info()
    • Guinier.compute_head_data_trend()
    • Guinier.comupute_bico_mono_ratio()
    • Guinier.determine_ipi_interval()
    • Guinier.estimate_rg()
    • Guinier.get_basic_result()
    • Guinier.get_qrg_limits_indeces()
    • Guinier.get_quality()
    • Guinier.get_result()
    • Guinier.update_result_with_bico_solver()
• AutorgKek.GuinierInterval
  • GuinierInterval
    • GuinierInterval.get_optimal_interval()
  • InvervalEvaluationModel
• AutorgKek.GuinierPorodFit
  • GuinierPorodFit
    • GuinierPorodFit.equations()
    • GuinierPorodFit.estimate_init_params()
    • GuinierPorodFit.fit()
• AutorgKek.HeadAnomalies
  • HeadAnomalies
    • HeadAnomalies.evaluate_slope()
    • HeadAnomalies.remove_head_anomalies()
    • HeadAnomalies.remove_head_anomalies_impl()
• AutorgKek.IntensityData
  • ACCEPTABLE_BASIC_QUALITY
  • IntensityData
    • IntensityData.add_smoother()
    • IntensityData.compute_basic_range()
    • IntensityData.compute_positive_ratio()
    • IntensityData.copy()
    • IntensityData.evaluate_range()
    • IntensityData.get_acceptable_XYW()
    • IntensityData.get_approximate_range()
    • IntensityData.get_guinier_valid_xy()
    • IntensityData.get_usable_range()
    • IntensityData.has_acceptable_quality()
    • IntensityData.initialize()
    • IntensityData.observe_basic_condition()
    • IntensityData.set_comments()
• AutorgKek.KekTools
  • AutorgKek
    • AutorgKek.debug_plot()
    • AutorgKek.run()
    • AutorgKek.seartch_for_start()
    • AutorgKek.seartch_for_stop()
    • AutorgKek.solve_by_annealing()
  • DummyFit
  • autorg()
• AutorgKek.KekToolsGP
  • AutorgKek
    • AutorgKek.adjust_to_qrg_limits()
    • AutorgKek.proof_plot()
    • AutorgKek.run()
  • DEBUG
  • autorg()
• AutorgKek.LightObjects
  • AnyObject
  • LightFit
  • LightIntensity
  • LightResult
• AutorgKek.LinRegSmoother
  • Smoother
    • Smoother.predict()
• AutorgKek.LinearModel
  • linear_model()
• AutorgKek.ODR_WLS
  • ODR_WLS
    • ODR_WLS.fit()
  • ODR_WLS_Result
    • ODR_WLS_Result.cov_params()
• AutorgKek.QrgLimitsAdjuster
  • QrgLimitsAdjuster
    • QrgLimitsAdjuster.get_adjusted_result()
    • QrgLimitsAdjuster.minimize_lower_limit()
    • QrgLimitsAdjuster.try_extending_right()
    • QrgLimitsAdjuster.try_loop()
    • QrgLimitsAdjuster.try_shifting_left()
  • ResultEvaluator
    • ResultEvaluator.can_be_improved()
    • ResultEvaluator.is_valid()
  • Struct
• AutorgKek.Quality
  • Quality
    • Quality.degrade_by_anomalies()
    • Quality.get_factors()
    • Quality.get_factors_with_fit_score()
    • Quality.get_raw_factors()
    • Quality.update_quality()
  • compute_atsas_fit_consistency()
  • fit_consistency_func()
  • fit_consistency_with_stdev()
  • fit_score_func()
  • get_factor_weights()
  • is_better_quality()
  • q_rg_score_func()
• AutorgKek.Result
  • Result
    • Result.get_atsas_signal()
    • Result.get_kekpf_signal()
    • Result.get_quality_signal()
• AutorgKek.ResultPrinter
  • ResultPrinter
    • ResultPrinter.print_detail_line()
    • ResultPrinter.print_header_line()
    • ResultPrinter.print_result()
    • ResultPrinter.print_result_multiple()
    • ResultPrinter.print_result_single()
• AutorgKek.SAngler_WLS
  • SAngler_WLS
    • SAngler_WLS.fit()
  • SAngler_WLS_Result
    • SAngler_WLS_Result.cov_params()
• AutorgKek.Settings
  • check_version_stamp()
  • clear_settings()
  • get_setting()
  • initialize()
  • overriding_init()
  • reload_settings()
  • save_settings()
  • set_setting()
• AutorgKek.SmoothSpline
  • SmoothSpline
• AutorgKek.WLS_Basics
  • OLS
    • OLS.fit()
  • Result
    • Result.cov_params()
  • WLS
    • WLS.fit()
• AutorgKek.WLS_Rg
  • LS_Rg
    • LS_Rg.set_result()
  • ODR_WLS_Rg
  • OLS_Rg
  • SAngler_WLS_Rg
  • WLS_HeadTrend
    • WLS_HeadTrend.compute_trend()
  • WLS_Rg